按照和议的约定，蒙元政权应在霹雳十八年底前撤离汉地，但真金的皇位大典之后，忽必烈的病情愈加严重，无法承受寒冬中的车马劳顿，为此真金向霹雳军提出暂缓撤出汉地。对于蒙元政权延迟撤离汉地的要求，霹雳军高层产生了不同的意见，有人义愤填膺要以雷霆之势击灭元军；有的认为鞑子背信弃义乃是常事，不可相信，主张断绝一切往来；还有人认为蒙元可能在蕴酿阴谋，采取拖延之计是为了争取时间。欧阳轩并不同意以上说法，在他看来真金刚登大位便逼其北撤，可能导致路途中忽必烈病重气绝。一旦如此真金极可能与霹雳军鱼死网破，因为其不为父复仇，必然导致蒙元政权内乱。不如同意真金所请，以助其巩固权力。
对霹雳军来说，与汉化颇深的真金打交道，胜过那些顽冥不化的蒙古贵族。那些蒙古贵族以恪守传统为由，以武力为荣，以抢掠为天性，视汉人为吃草籽的“两脚羊”。如果没有真金约约束他们，这野蛮人即便退出汉地，也会不断骚扰劫掠边境。霹雳军虽能将其消灭，但也会付出极大的财力物力。游牧骑兵来去无影，行踪飘忽不定，情况不利则退往广袤的草原深处，十分让人头痛。眼下霹雳军尚未掌控北方汉地，南方仍有数十万伪军，还不是对付顽固派蒙古贵族的时候。基于同样的原因，欧阳轩指示曹轩暂时不要攻打大同府。真金在信中同时提到，因风雪过大，大同府的奥鲁赤部元军也无法行军，要求开春再撤退往草原。
欧阳轩之所以力排众议，同意大都和大同府的元军开春再撤离，除了政治上原因外，也有气侯因素。通州的陆战军兵员中有相当部分是北方汉人、高丽人、女真人，倒能适应寒冬，加上船只在入冬前便运来大量的粮食、肉类和煤等燃料，吃穿取暖不愁。昝万寿第二军和曹轩第一军的士兵多为南方人，虽然曾到松、茂州的高寒之地进行过适应性训练，但真在北方过冬却颇不适应。更关键的是，这两军的粮草弹药补给多走陆路，运输效率低且距离远。在寒冬到来前，为了保证士兵不受饥寒之苦，只得将运力用于保障粮草和燃料，为此停止了弹药的运输。弹药特别是炮弹不足，削弱了两军发动大规模进攻的能力。
在欧阳轩看来，自金人入主中原以来，北方汉地落入异族手中已一百五十年，燕云十六州自石敬塘割让给契丹距今也三百余年，再推迟几月也无妨。有强大的武力作为后盾，他并不怕蒙元政权可能的阴谋诡计，也不怕真金不信守承诺。如果因为政治上缺乏灵活性，而选择与蒙元政权死磕，对霹雳军并不利。一方面会徒增霹雳军将士的伤亡，另一方面也会导致下一步战略的失败。在欧阳轩的计划中，不管真金的蒙元政权愿不愿意，他们都将在霹雳军强大的武力下，被迫往西迁陡，成为霹雳军收复西域的先锋。将蒙元政权打得太狠，或将其打残打废，并不符合霹雳军的利益。
开春之后，元军如约撤退了。奥鲁赤部离开大同后，前往了河套平原，前去增援在可敦城的安童和那木罕。得知蒙元被霹雳军打得节节败退的消息后，海都自然不会放过“趁你病要你命”的机会，他在钦察汗国和察合台汗国的支持下，率二十万骑兵往可敦城进发。大都城的元军则兵发两路，分别往北方草原和辽东方向而去。重病在身的忽必烈没有熬过寒冬。遵照其意愿，真金将其灵柩带回斡难河畔。按照蒙古传统，忽必烈的灵柩将在埋在草地之后被万马踏平，送葬之人则被全部杀死，草长成之后将无人知晓。留在上都陵墓的守卫，守护的其实是其衣冠冢。
元军撤退之后，第一军和海军陆战军并没有马上进入大同府和大都城，而是按照医学院的要求，先派人进城，发动城中居民进行大清扫，又运来生石灰进行了消毒。蒙元贵族出行皆骑乘马匹又喜食牛羊，城中牲畜众多粪便遍地，极易滋生病菌。更重要的是蒙古人惯用生化武器，曾在西征之时用投石机将病死的人畜尸体抛入敌人城内，使守军及百姓患上黑死病。自此之后，这种令人闻风色变的瘟疫肆虐西方，杀死了上千万的人口，无数的村庄和城市也由此变得空荡荡。
在元军撤离的过程中，有不少汉人百姓随行，他们都是自愿的。这些人多是汉人官员和世家大族，受异族奴役久了，反而视霹雳军为异类，而奉蒙元政权为正朔。按照和议要求，元军可以带走府库金银和粮草，但不准劫掠百姓，更不允许强迫百姓前往草原。由于真金的严令，大都城的元军并没有放肆劫掠，况且陆战军的骑兵师也会不答应他们肆意妄为。大同府奥鲁赤并不能压住手下的骄兵悍将，不少军将在临走时大肆抢劫财物和女子，使得撤退路上哀嚎声不绝。曹轩眼见如此敌人如此嚣张，当即命令发动攻击，元军只得丢下财物女子逃命。曹轩那里肯让敌人如此逃走，直至奥鲁赤将带头劫掠的元军兵将头颅送来才罢兵。
元军退出汉地之后，曹轩的第一军接管了燕云十六州的防务。其下的三个步兵师分别驻防大同府、大都城和野狐岭附近的宣德州，骑兵师则驻防保州作为机动部队。吴青在将大都防务交给第一军后，率军部及骑兵师和一个步兵师进驻卢龙——欧阳轩叫山海关。卢龙乃是扼守辽东与中原的咽喉要地，虽然此时并无关隘。陆战军的另外二个步兵师，一个进驻胶州半岛的登州，以肃清山东的残余元军和匪患。塔出和博罗欢率元军主力仓促退走后，仍有数千蒙古汉军盘崌山东，他们与当地的土匪沆瀣一气，已成巨大隐患。另一个步兵师则进驻辽东半岛屿最南端的金州。霹雳军高层已经决定在金州建设一座军港，并驻扎北海舰队的一支分舰队。
元军退出汉地之后，前出保州的第二军一个师兵力，也开始南返洛阳。此时昝万寿率第二军的主力已经离开洛阳和开封南下樊城，他们将在溯汉水而上的第三军一部的配合下，合攻襄阳城。至于第三军的主力，则是张珏的率领下，攻打占据庐州（合肥）的夏贵。